通用转录因子(英语:General transcription factor,GTFs)是最基本的转录因子,为一群转录因子蛋白,键结于DNA的特殊位置以活化转录。GTFs、RNA聚合酶和辅活化子再加上蛋白质组成了转录的一个装置。GTFs和基因调节有密切关系,对生命有重要关系。 在细菌中,转录起始需要一个RNA聚合酶,和一个单一的GTF:σ因子 在古菌和真核生物中,转录起始需要RNA聚合酶,和一连串多种的GTFs。真核生物的转录起始借由RNA聚合酶II牵涉到以下的GTFs: TFIIA TFIIB TFIID TFIIE TFIIF TFIIH
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| 信号传送途径 | GPCR( 刺猬、 Wnt) · RTK( TGFβ、 MAPK/ERK) · Notch · JAK-STAT · Akt/PKB · Fas凋亡 · hippo · PI3K/AKT/mTOR途径 · 整联蛋白受体 |
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| 因素 |
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| 细胞内信号
肽与蛋白
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信号转导衔接蛋白:支架蛋白质
第二信使: cAMP依赖途径 · Ca2+信号 · 脂类信号传送 · IP3/DAG途径 |
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| 通用 · 转录前起始复合物 · TFⅡD、TFⅡH |
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| 位置 | |
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| 其它概念 | |
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(1) 碱性结构域
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| 转录激活因子(AATF、1、2、3、4、5、6、7) · AP-1(c-Fos、FOSB、FOSL1、FOSL2、c-Jun、JUNB、JUND) · BACH(1、2) · BATF · BLZF1 · C/EBP(α、β、γ、δ、ε、ζ) · CREB(1、3、L1) · CREM · DBP · DDIT3 · GABPA · HLF · MAF(B、F、G、K) ·
NFE(2、L1、L2、L3) · NFIL3 · NRL · NRF(1、2、3) · XBP1 |
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| (1.2)碱性螺旋-环-螺旋
(bHLH)
| ATOH1 · AhR · AHRR · ARNT · ASCL1 · BHLHB2 · BMAL(ARNTL、ARNTL2) · CLOCK · EPAS1 · HAND(1、2) · HES(5、6) ·
HEY(1、2、L) · HES1 · HIF(1A、3A) · ID(1、2、3、4) · LYL1 · MXD4 · MYCL1 · MYCN · Neurogenins(1、2、3 · Myogenic regulatory factors(MyoD、成肌蛋白、MYF5、MYF6) · NeuroD(1、2) · NPAS(1、2、3) · OLIG(1、2) · Pho4 · Scleraxis · TAL(1、2) · Twist · USF1 |
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| (1.3)bHLH-ZIP
| AP-4 · MAX · MITF · MNT · MLX · MXI1 · Myc · SREBP(1、2) |
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| (1.4) NF-1
| NFI(A、B、C、X) · SMAD(R-SMAD(1、2、3、5、9) - I-SMAD(6、7) - 4) |
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| (1.5) RF-X
| RFX(1、2、3、4、5、ANK) |
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| (1.6)碱性螺旋-跨-螺旋
(bHSH)
| AP-2(α、β、γ、δ、ε) |
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| 第一亚族: 甲状腺激素受体( α、 β)、 CAR、 FXR、 LXR( α、 β)、 PPAR( α、 β/δ、 γ)、 PXR、 RAR( α、 β、 γ)、 ROR( α、 β、 γ)、 Rev-ErbA( α、 β)、 VDR
第二亚族( COUP-TF( I、 II)、 Ear-2、 HNF4( α、 γ)、 PNR、 RXR( α、 β、 γ)、 Testicular receptor( 2、 4)、 TLX)
第三亚族( 甾类激素受体( 雄激素、 雌激素( α、 β)、 糖皮质激素、 盐皮质激素、 孕酮)、 Estrogen related( α、 β、 γ))
第四亚族 NUR( NGFIB、 NOR1、 NURR1) · 第五亚族 LRH-1、 SF1 · 第六亚族 GCNF · 第零亚族 DAX1、 SHP |
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| (2.2) 其他的Cys4结构
| GATA(1、2、3、4、5、6) · MTA(1、2、3) · TRPS1 |
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| (2.3) Cys2His2
| 通用转录因子(TFⅡA、TFⅡB、TFIID、TFⅡE、TFⅡF(1、2)、TFⅡH(1、2、4、2I、3A、3C1、3C2)) ATBF1 · BCL(6、11A、11B) · CTCF · E4F1 · EGR(1、2、3、4) · ERV3 · GFI1 · GLI-Krüppel family(1、2、3、REST、S2、YY1) ·
HIC(1、2) · HIVEP(1、2、3) · IKZF(1、2、3) · ILF(2、3) · KLF(2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、17) · MTF1 · MYT1 · OSR1 · SP(1、2、4、7) · WT1 · Zbtb7(7A、7B) · ZBTB(16、17、20、32、33、40) · zinc finger(3、7、9、10、19、22、24、33B、 34、35、41、43、44、51、74、143、146、148、165、202、217、219、238、239、259、267、268、281、295、318、330、346、350、365、366、384、 423、451、452、471、593、638、649、655) |
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| (2.4) Cys6
| HIVEP1 |
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| (2.5)交替composition
| AIRE · DIDO1 · GRLF1 · ING(1、2、4) · JARID(1A、1B、1C、1D、2) · JMJD1B |
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| (2.6) WRKY
| WRKY |
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(3)螺旋-转角-螺旋结构域
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(3.1) 同源异型域
| ARX · CDX( 1、 2) · CRX · CUTL1 · DBX( 1、 2) · DLX( 3、 4、 5) · EMX2 · EN( 1、 2) · FHL( 1、 2、 3) · HESX1 · HHEX · HLX · 同源框( A1、 A2、 A3、 A4、 A5、 A7、 A9、 A10、 A11、 A13、 B1、 B2、 B3、 B4、 B5、 B6、 B7、 B8、 B9、 B13、 C4、 C5、 C6、 C8、 C9、 C10、 C11、 C13、 D1、 D3、 D4、 D8、 D9、 D10、 D11、 D12、 D13) · HOPX · IRX( 1、 2、 3、 4、 5、 6、 MKX) · LMX( 1A、 1B) · MEIS( 1、 2) · MEOX2 · MNX1 · MSX( 1、 2) · NANOG · NKX( 2-1、 2-2、 2-3、 2-5、 3-1、 3-2、 6-1、 6-2) · PBX( 1、 2、 3) · PHF( 1、 3、 6、 8、 10、 16、 17、 20、 21A) · PITX( 1、 2、 3) · POU结构域( PIT-1、 BRN-3: A、 B、 C、 八聚体转录因子: 1、 2、 3/4、 6、 7、 11) · OTX( 1、 2) · PDX1 · ZEB( 1、 2) |
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| (3.2)配对框
| PAX(1、2、3、4、5、6、7、8、9) |
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| (3.3) Fork head / winged helix
| E2F(1、2、3、4、5) · FOX proteins(C1、C2、D3、E1、G1、H1、K2、L2、M1、N3、O1、O3、O4、P1、P2、P3) |
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| (3.4) Heat Shock Factors
| HSF(1、2、4) |
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| (3.5) 色氨酸簇
| ELF(2、4、5) · EGF · ELK(1、3、4) · ERF · ERG · ETS(1、2、SPIB) · ETV(1、4、5、6) · FLI1 · Interferon regulatory factors(1、2、3、4、5、6、7、8) · MYB · MYBL2 |
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| (3.6) TEA结构域
| transcriptional enhancer factor(1、2、3、4) |
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(4) β-Scaffold factors with minor groove contacts
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(4.1) Rel homology region
| NF-κB(NFKB1、NFKB2、REL、RELA、RELB) · NFAT(C1、C2、C3、C4、5) |
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| (4.2) STAT
| STAT(1、2、3、4、5、6) |
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| (4.3) p53
| p53 · TBX( 1、 2、 3、 5、 19、 21、 22、 Brachyury、 TBR1) |
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| (4.4) MADS盒
| Mef2(A、B、C、D) · SRF |
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| (4.6) TATA结合蛋白
| TATA结合蛋白 · TBPL1 |
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| (4.7) 高速泳动族
| BBX (基因) · HMGB(HMGB1、HMGB2、HMGB3、HMGB4) · HMGN、(HMGN1、HMGN2、HMGN3、HMGN4) · HNF(1A、1B) · LEF1 · SOX(1、2、3、4、5、6、8、9、10、11、12、13、14、15、18、21) · SRY · SSRP1 ·
TCF(3、4) · TOX(1、2、3、4) |
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| (4.9) Grainyhead
| TFCP2 |
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| (4.10) Cold-shock domain
| CSDA、YBX1 |
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| (4.11) Runt
| CBF(CBFA2T2、CBFA2T3、RUNX1、RUNX2、RUNX3、RUNX1T1) |
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(0) 其他转录因子
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(0.2) HMGI(Y)
| HMGA(1、2) · HBP1 |
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| (0.3) 袋状结构域
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| (0.5) AP-2/EREBP-related factors
| Apetala 2 · EREBP · B3 |
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| (0.6) Miscellaneous
| ARID(1A、1B、2、3A、3B、4A) · CAP · IFI(16、35) · MLL(2、3、T1) · MNDA · NFY(A、B、C) · ρ因子/σ因子 |
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| | see also transcription factor/coregulator deficiencies 模板:Protein biosynthesis navs |
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参考来源