内生孢子(英语:endospore,又称芽孢或内孢子)是某些特殊种群的细菌,主要是芽孢杆菌属Bacillus与梭菌属Clostridium中细菌产生的特殊休眠体,有极强的抗逆性,对热、碱、酸、高渗以及辐射均有强耐受性。通常使用的杀灭芽孢的方法为高压灭菌。普通的巴斯德消毒法无法杀灭芽孢。
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细胞膜
细胞壁:肽聚糖(NAM、NAG、二氨基庚二酸)
仅存在于革兰氏阳性菌中:磷壁酸 · 脂磷壁酸 · 内生孢子
仅存在于革兰氏阴性菌中:细菌外膜(普通细菌孔道蛋白家族、脂多糖) · 周质空间